自然交配是公母鸭在有水的环境中自行交配的交配方法。配种季节-一般是每年的2-6月，也就是从初春开始，到夏至结束，自然配种有两种方式。
1、大群配种
将公母鸭按一定比例组合饲养，组的大小取决于鸭群的规模和配种环境的面积，一般利用池塘、河湖等水面让鸭子玩耍。该方法可使每只公鸭有机会与母鸭自由组合交配，受精率高，特别是放牧鸭受精率高，适用于繁殖生产群。但是需要注意的是，大群配种时，种公鸭的年龄和体质要相似，体质差，年龄大的种公鸭，没有竞配能力，不适合大群配种。
2、小群配种
每只鸭子及其负责配种的鸭子单间饲养，每只鸭子配种规定的鸭子，每个饲养间设置水栏，交配鸭子的活动。公鸭和母鸭都有脚号。每只母鸭晚上在固定的产蛋窝里产蛋。种蛋记录公鸭和母鸭的脚号。此方法可确知雏鸭的父母，适用于育鸭，是鸭场常用的方法。
