一是发酵床生态养鸭解决了鸭粪处理困难的问题，粪便通过垫子中的微生物发酵分解成菌蛋白为鸭子提供营养，舍内无臭味，无蚊蝇，环境清新，解决了新农村建设问题。另外，鸭舍垫料每三年清一次，鸭粪越陈，作为饲料的营养价值越高。
二是鸭疾病减少，提高了鸭肉品质。微生物制剂中含有能降低或抑制生长有害物质的酶，如硝酸还原酶、偶氮还原酶等，因而抑制了有害菌的生成，减少了鸭的疾病。减少鸭病，就减少了抗生药的使用，提高了鸭肉品质。
三是劳动生产效率大大提高，鸭舍不需要每天清粪，自动饮水，节省劳动力，节省劳动力50%以上。
四是提高了饲料转化率和营养吸收率，提高了鸭的生长速度，提早4天出栏。微生物制剂的使用，产生不同的代谢产物，为鸭子提供有利于消化吸收的营养物质。可以改变鸭舍的环境，使饲料得到充分转化和吸收，料肉比达到良好的效果，降低养鸭成本，提高养鸭的经济效益。即使是在夏季，以发酵床为基础建造的微生态鸭舍也沉浸在安静、清爽、没有异味之中，从而杜绝了球虫病等几种传染源，这样就从另外一条途径降低了养鸭的成本。
五是提高了养鸭经济效益。生态养鸭的第一投入成本高于传统养鸭，但从长远来看，每只鸭可以节约医药、饲料、水电等成本。
六是为解决秸秆堆积、焚烧问题提供了一条出路，每20平方米的垫料床就可以消纳1亩地的玉米秸秆。
