牛场定期消毒的目的是消灭散播与牛舍内空气中和附着于墙壁地面的病原微生物，切断传播途径，保护人畜健康。因此，必须定期消毒环境、牛舍、地面土壤、粪便、污水等。
1、环境消毒
牛舍周围环境定期用2%火碱或撒生石灰消毒。周围和场内污染池、粪池、下水道出口，每月用漂白粉消毒一次。
2、牛舍消毒
一般情况下，消毒每周1次，每年再进行2次大消毒。消毒可用1:1800～3000的百毒杀。对于病牛舍和隔离舍，在其出口处放置有消毒液的麻袋片和草垫的消毒液可以使用2%~4%氢氧化钠、1%菌毒敌(对于病毒性疾病)或者10%克辽林溶液。
3、地面土壤消毒
土壤表面可用10%漂白粉溶液、4%福尔马林或10%氢氧化钠溶液。存放由芽孢杆菌引起的传染性疾病(如炭疽)牛尸体的场所，应严格消毒，先用上述漂白粉喷向地面，然后挖出表土30厘米左右，撒上干漂白粉，再与土混合，将此表土运出掩埋。
4、粪便消毒
牛的排泄物多采用生物热灭菌方法，即在牛100~200米以外的地方建一个粪堆，将牛粪堆叠起来，上面覆盖10厘米厚的沙土，堆叠发酵1~3个月，就可以用作肥料了。
5、污水消毒
将污水引入处理池，加入化学药品(如漂白粉或其他氯制剂)消毒，用量取决于污水量，一般一升污水使用2~5克漂白粉。
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